Instalado en el magnífico edificio del arquitecto Rafael Moneo, el museo alberga los principales hallazgos arqueológicos de la antigua ciudad romana Augusta Emérita, hoy conocida como Mérida en la provincia extremeña de Badajoz.
Junto con el Teatro y demás edificios adyacentes, el museo forma parte del llamado Conjunto Arqueológico de Mérida declarado Patrimonio de la Humanidad por la Unesco.
Escultura, mosaicos, numismática así como importantes piezas de cerámica y vidrio forman el principal núcleo de sus colecciones.